Ahí se encontraba el chico, dentro de un elevador en ascenso. Al llegar a la parte superior, se encuentra rodeado de varios chicos a los que no conoce, quienes están en una pequeña área verde rodeada de grandes paredes de piedra. Alby que es el líder del área, le explica al chico que al igual que todos los que están allí, perdió la memoria y fue enviado desde el elevador hasta ese lugar. En el transcurso del día, el chico conoce a Chuck y a Newt mientras se va asociando al lugar. Al llegar la noche, se realiza una fiesta para celebrar la llegada del chico nuevo. Newt comenta que algunos de los que están allí llevan hasta tres años encerrados, puesto que la única manera de salir es cruzando el laberinto, pero el mismo está lleno de monstruos apodados penitentes, ya que estos atacan por la noche al cerrarse las puertas, y solo se le permite a los corredores entrar en él. Antes de que Newt continúe, el chico nuevo es invitado por Gally a pelear con él de manera amistosa. En medio de la pelea, tras un fuerte golpe en la cabeza, el chico recobra parte de su memoria y dice que su nombre es Thomas.


A los pocos días, el ascensor sube otra vez y hallan a la primera chica que se haya visto, con una nota que decía que ella sería la última. Mientras ella se mantiene inconsciente, Thomas y Minho exploran junto a tres habitantes el laberinto, para buscar los restos del penitente que habían matado en la noche. En él descubren un dispositivo que marcaba el número siete. Más tarde, la chica despierta y causa un alboroto hasta que Thomas habla con ella y descubre que su nombre es Teresa.


Al día siguiente, Thomas y Minho entran al laberinto y son guiados por el dispositivo del penitente hasta una presunta salida ubicada en el sector siete, pero al intentar abrirla, el sector comienza a cerrarse y se ven obligados a abandonarlo. Al volver, comienzan a explicar todo lo ocurrido, en eso, se crea un alboroto en el área puesto que las puertas del laberinto no se cerraron. Por el contrario, se abrieron tres nuevas, de las cuales emergieron docenas de penitentes que mataron a gran parte de los habitantes. Al amanecer, Gally culpa a Thomas de todo lo ocurrido, dado que desde su llegada, comenzaron a ocurrir cosas fuera de lo común. Él y los sobrevivientes intentan sacrificarlo junto a Teresa, pero gracias a la ayuda de Chuck, Newt y Minho ellos se salvan...